V okolí je možno provozovat i vodní turistiku, tok řeky Moravy leží na hranicích Kojetína a je sjízdný směrem do Tovačova i Kroměříže. Bohatou tradici má v Kojetíně vodácký sport, jehož členové mají sídlo v loděnici na soutoku Moravy a Mlýnského náhonu. Každoročně v srpnu rozvíří řeku Moravu závody dračích lodí (Draci na Hané - Dračí Morava).Více informací naleznete na stránkách Vodáckého oddílu Kojetín.